Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms