Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms