Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms