Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms