Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CROCC2H7BZ55 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms