Protein–RNA interactions for Protein: H0Y7S4

PRAMEF26, Putative PRAME family member 26, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF26H0Y7S4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF26H0Y7S4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF26H0Y7S4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms