Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms