Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DXG7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DXG7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DXG7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DXG7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DXG7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DXG7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DXG7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DXG7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DXG7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DXG7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DXG7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DXG7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DXG7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DXG7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B4DXG7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B4DXG7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DXG7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DXG7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DXG7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DXG7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DXG7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DXG7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DXG7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DXG7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DXG7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DXG7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DXG7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DXG7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DXG7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DXG7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DXG7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DXG7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DXG7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DXG7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DXG7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DXG7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DXG7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DXG7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DXG7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DXG7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DXG7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DXG7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DXG7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DXG7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DXG7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B4DXG7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DXG7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DXG7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DXG7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DXG7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DXG7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DXG7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DXG7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DXG7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DXG7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DXG7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DXG7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DXG7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DXG7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DXG7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms