Protein–RNA interactions for Protein: B4DSR2

cDNA FLJ52234, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DSR2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DSR2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DSR2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DSR2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DSR2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DSR2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DSR2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DSR2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DSR2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DSR2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DSR2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DSR2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DSR2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DSR2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DSR2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DSR2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms