Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HMGB1P1B2RPK0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms