Protein–RNA interactions for Protein: A6NIL9

CRYM-AS1, Putative uncharacterized protein CRYM-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYM-AS1A6NIL9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRYM-AS1A6NIL9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRYM-AS1A6NIL9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRYM-AS1A6NIL9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRYM-AS1A6NIL9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRYM-AS1A6NIL9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRYM-AS1A6NIL9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRYM-AS1A6NIL9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRYM-AS1A6NIL9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRYM-AS1A6NIL9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms