Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRCP1A6NGW2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms