Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms