Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L4A6NCW7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms