Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms