Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC144AA2RUR9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC144AA2RUR9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms