Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ARL2-SNX15V9GYD0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms