Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMTA1Q9Y6Y1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAMTA1Q9Y6Y1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms