Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms