Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms