Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y1

POLR3K, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3KQ9Y2Y1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR3KQ9Y2Y1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms