Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms