Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms