Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2F5

ICE1, Little elongation complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ICE1Q9Y2F5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ICE1Q9Y2F5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ICE1Q9Y2F5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ICE1Q9Y2F5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ICE1Q9Y2F5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ICE1Q9Y2F5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms