Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms