Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms