Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SETD1BQ9UPS6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SETD1BQ9UPS6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SETD1BQ9UPS6 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SETD1BQ9UPS6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SETD1BQ9UPS6 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SETD1BQ9UPS6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SETD1BQ9UPS6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SETD1BQ9UPS6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SETD1BQ9UPS6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SETD1BQ9UPS6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SETD1BQ9UPS6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SETD1BQ9UPS6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SETD1BQ9UPS6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SETD1BQ9UPS6 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SETD1BQ9UPS6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SETD1BQ9UPS6 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SETD1BQ9UPS6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SETD1BQ9UPS6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SETD1BQ9UPS6 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SETD1BQ9UPS6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SETD1BQ9UPS6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SETD1BQ9UPS6 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SETD1BQ9UPS6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SETD1BQ9UPS6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SETD1BQ9UPS6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SETD1BQ9UPS6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SETD1BQ9UPS6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SETD1BQ9UPS6 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms