Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULZ9

MMP17, Matrix metalloproteinase-17, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP17Q9ULZ9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MMP17Q9ULZ9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MMP17Q9ULZ9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MMP17Q9ULZ9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
MMP17Q9ULZ9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MMP17Q9ULZ9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MMP17Q9ULZ9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MMP17Q9ULZ9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MMP17Q9ULZ9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MMP17Q9ULZ9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MMP17Q9ULZ9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MMP17Q9ULZ9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MMP17Q9ULZ9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MMP17Q9ULZ9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MMP17Q9ULZ9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MMP17Q9ULZ9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MMP17Q9ULZ9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MMP17Q9ULZ9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MMP17Q9ULZ9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MMP17Q9ULZ9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MMP17Q9ULZ9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MMP17Q9ULZ9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MMP17Q9ULZ9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MMP17Q9ULZ9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MMP17Q9ULZ9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MMP17Q9ULZ9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MMP17Q9ULZ9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MMP17Q9ULZ9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MMP17Q9ULZ9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MMP17Q9ULZ9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MMP17Q9ULZ9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MMP17Q9ULZ9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MMP17Q9ULZ9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MMP17Q9ULZ9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MMP17Q9ULZ9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MMP17Q9ULZ9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms