Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms