Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

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Length 816 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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TPCN1Q9ULQ1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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TPCN1Q9ULQ1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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TPCN1Q9ULQ1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPCN1Q9ULQ1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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