Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms