Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO3Q9UK99 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
FBXO3Q9UK99 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO3Q9UK99 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO3Q9UK99 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO3Q9UK99 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO3Q9UK99 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO3Q9UK99 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO3Q9UK99 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO3Q9UK99 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO3Q9UK99 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO3Q9UK99 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO3Q9UK99 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO3Q9UK99 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO3Q9UK99 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO3Q9UK99 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO3Q9UK99 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO3Q9UK99 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO3Q9UK99 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO3Q9UK99 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO3Q9UK99 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO3Q9UK99 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO3Q9UK99 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO3Q9UK99 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO3Q9UK99 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO3Q9UK99 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO3Q9UK99 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO3Q9UK99 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO3Q9UK99 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO3Q9UK99 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO3Q9UK99 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms