Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA3Q9UI47 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms