Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV9

PFDN2, Prefoldin subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN2Q9UHV9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PFDN2Q9UHV9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PFDN2Q9UHV9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PFDN2Q9UHV9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PFDN2Q9UHV9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PFDN2Q9UHV9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PFDN2Q9UHV9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PFDN2Q9UHV9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PFDN2Q9UHV9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PFDN2Q9UHV9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PFDN2Q9UHV9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PFDN2Q9UHV9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms