Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms