Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO40Q9UH90 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO40Q9UH90 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms