Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NKX1-2Q9UD57 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms