Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms