Protein–RNA interactions for Protein: Q9P270

SLAIN2, SLAIN motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAIN2Q9P270 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLAIN2Q9P270 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLAIN2Q9P270 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms