Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms