Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM4

BICRA, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICRAQ9NZM4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC34.39■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
BICRAQ9NZM4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms