Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
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