Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms