Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms