Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms