Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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