Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms