Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1E5

TMX4, Thioredoxin-related transmembrane protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4Q9H1E5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMX4Q9H1E5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms