Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms