Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms